宋代，我國設(shè)立了世界上最早的藥局以管理藥事，其中包括制劑管理的和劑局、收購檢驗(yàn)和鑒別藥材的藥材所、銷售藥物的賣藥所，以及慈善機(jī)構(gòu)惠民局。為了校勘整理醫(yī)書，宋代政府成立了世界上最早的整理醫(yī)書的國家專門機(jī)構(gòu)——校正醫(yī)書局。在醫(yī)學(xué)教育上，宋代發(fā)明了世界上最早的醫(yī)學(xué)教學(xué)模型——針灸銅人。在醫(yī)藥研究方面，宋代還有諸多發(fā)現(xiàn)與發(fā)明，如用燒烙斷臍和烙臍餅子貼敷防止臍風(fēng)，從人尿中提取秋石（即性激素，有學(xué)者不同意秋石即性激素，并按歷史記載的方法進(jìn)行試驗(yàn)。但是從歷史文獻(xiàn)記載其功效判定作用與性激素相同），用全兔腦制作藥物以催生（實(shí)際上應(yīng)用了垂體后葉激素）。另外，宋代還產(chǎn)生了世界上較早的、最為系統(tǒng)的法醫(yī)學(xué)著作——《洗冤集錄》。
元代，在骨傷科和外科方面，發(fā)明了治療脊椎骨折的懸吊復(fù)位法和外科縫合用的縫合曲針。
